Justin se irrita com Alex por ela usar magia constantemente para atender às suas necessidades. Assim, ele cria um monstro fêmea para tomar conta de seu quarto a fim de agir como Alex. No entanto, o plano de Justin fracassa quando a garota-monstro e Alex se tornam amigas rapidamente.
Depois que os Russo são criticados pela Associação de Comerciantes de Waverly Place pelo fato da decoração de Halloween de sua "casa mal-assombrada" não ter sido assustadora o suficiente nos anos anteriores, a família se reúne para montar a casa mais assustadora de todas.
Depois que Justin domina seu feitiço de número 5.000, ele se inscreve no grupo de Caçadores de Monstros como o próximo passo para completar a sua formação de feiticeiro. Enquanto isso, Max faz com que sua consciência ganhe forma humana e liberta todos os monstros da cidade.
Justin inicia seu curso como Caçador de Monstros e descobre que existe três monstros a solta por Waverly Place, mas ele se vê em uma enrascada quando descobre que Julieta e sua família de vampiros são os monstros que ele está procurando, para piorar, ele avisa o caso para as autoridades mágicas e agora Alex e Harper precisam ajudar Justin a sair desta encrenca. Enquanto isso, a Consciência do Max obriga ele a fazer suas tarefas, mas Theresa acaba dando todo o crédito à Consciência, fazendo Max ficar com ciúmes.
Justin é convocado para rastrear uma múmia manipuladora de mentes assustadora como parte das suas funções de Caçador de Monstros. Ele e Julieta partem para o museu para controlar o monstro, mas as coisas tomam um rumo ruim quando Justin e Julieta ficam presos na exposição egipícia. Enquanto isso, Alex tenta separar Max de sua Consciência depois que ele começa a ficar excelente em seus estudos de feiticeiro, mas isso acaba fazendo a Consciência se tornar um indíviduo e Max um garoto rebelde.
Depois que Harper descobre que sua família está se afastando, os Russo se oferecem para deixar Harper viver com eles. Enquanto Alex e Harper limpam o porão para dar espaço para as coisas da Harper, Alex se encolhe para caber em uma antiga casa de bonecas e fazer dela seu próprio ateliê de arte. Porém, Jerry e Theresa doam a casa de bonecas a uma menina chamada Olívia sendo que Alex ainda continua dentro da casinha.
Depois da Harper ganhar uma maratona, ela descobre que Alex vem usado magia para ajudá-la a vencer todas as competições desde que elas eram bem pequenas. Triste por nunca realmente ganhar nada por conta própria, Alex decide recriar competições do passado a fim de que a Harper tenha a oportunidade de vencer sem a ajuda de magia. Enquanto isso, Justin decide entrar na maratona para que ele possa ser o primeiro Russo a ganhar um troféu atlético.
Alex começa a namorar Mason, um estudante que foi transferido da Inglaterra, perfeito em todos os sentidos, exceto pela sua visão artística. Então, Alex enfeitiça Mason, de modo que ela se torne uma inspiração para toda arte que ele criar em suas aulas de Artes.
Alex, Justin, Max e Mason vão a procura de Julieta que está com a múmia, mas Alex e Justin tem uma surpresa quando descobrem que Julieta e Mason se conhecem a 300 anos. Mason, que é um Lobisomem, diz que ele ama a Julieta, fazendo Alex ficar inconsolável. Mason volta para falar com Alex e a leva de volta para Transilvânia, onde Justin e Mason acabam brigando e Julieta luta contra Mason, que arranha ela e Julieta morde ele. Por causa do arranhão de Mason, Julieta perde os poderes de vampira, fica velha e revela à Justin sua verdadeira idade. E, por causa da mordida de Julieta, Mason vira um lobo para sempre.
Alex fica apaixonada por George, líder da banda da escola, mas ela não consegue falar com ele por causa de sua atitude rude e energética. Determinada a chamar George para o baile, ela usa uma caneta mágica para se tornar uma pessoa positiva, mas o recém otimismo da Alex começa a subir à sua cabeça quando ela começa a torcer para a equipe adversária. Enquanto isso, Justin tenta se juntar à equipe de basquete.
Justin e Zeke estão concorrendo um contra o outro para se tornar Presidente do Corpo Discente. Justin logo descobre que todo o seu esforço corre perigo depois que alguém cola cartazes da campanha de Justin no gabinete do Sr. Laritate e ele é acusado de comandar tal "vandalismo". Na detenção de sábado, Alex faz amizade com uma garota rebelde nova na escola chamada Stevie. Em sua viagem para Coney Island, Jerry, Max e Harper ficam presos em uma roda-gigante, e Max deixa sua varinha cair em uma tentativa de teletransportá-los. Harper é teletransportada para fora da roda-gigante por Alex e ambas tentam ajudar Justin a sair desta encrenca. Enquanto isso, Justin ganha popularidade e fica amigo de Eddie, porém, isto pode custar a amizade de Zeke.
Alex, Justin e Max ficam chocados ao saber que a estrela pop internacional Shakira, é, na verdade, seu Tio Kelbo, que vem abusando de uma das Onze Regras do Regulamento dos Feiticeiros. Infelizemente, Kelbo não consegue mais se controlar quando a transformação acontece, e Max diz um feitiço que o deixa com o mesma problema que seu tio, exceto pelo fato de que ele vira uma lata de lixo.
Justin contrata uma banda de jazz para tocar na hora do almoço no refeitório da escola, porém Alex e Stevie não gostam da ideia e contratam uma banda de rock. Quando Stevie vê uma briga feia entre Alex e Justin, ela lança um feitiço na banda de rock para que ela toque somente jazz. Harper descobre que Stevie é uma feiticeira e ameaça contar à Alex, mas Stevie a enfeitiça, fazendo com que ela esqueça o que iria dizer.
Quando Harper lembra que Stevie é uma feiticeira, com a ajuda de Alex, ela passa a se sentir excluída do gupo, depois que Alex e Stevie passam a andar juntos, se esquecendo de Harper. Quando Alex, Harper e Stevie acidentalmente acabam participando do comitê do baile de Outuno liderado por Justin e Zeke, Alex e Stevie abandonam todo o trabalho, o deixando nas mãos de Harper. Assim, Justin é obrigado a passar-se por Alex, usando magia contra seus princípios, para que Harper continue a ajudar.
Alex, Justin e Harper descobrem onde o irmão de Stevie está e vão conversar com ele, porém, eles descobrem que Stevie fugiu durante a transferência de poderes e para piorar, ao voltarem para a toca, descobrem que ela está organizando uma revolução de feiticeiros para que ninguém tenha de abandonar seus poderes. Stevie chama Alex para ajudá - la, o que faz com que Justin e Harper acabem discutindo para ver se Alex ia ajudar Stevie ou não, mas no final, Alex congela Stevie e dá seus poderes ao irmão dela.
O Superintendente Clanton visita a escola de Alex, Justin e Max e acha que o Sr. Laritate não é muito rígido com os alunos. Então, ele o demite e se torna o novo diretor, trazendo mudanças à escola, como o uso obrigatório de uniforme pelos alunos. Assim, Alex usa um feitiço que leva o Sr. Laritate de volta no tempo do Velho-Oeste para tentar convencê-lo a lutar para ter seu emprego de volta e trazer a escola ao normal.
Quando Alex tenta vender camisetas na escola, Justin diz que ela terá que pagar uma taxa ao Conselho Estudantil, para vendê-las nas propriedades da escola. Com sua generosa doação, Alex ganha o Prêmio Cidadania. Justin acredita que ela usou magia para obter o prêmio, então, ele lança um feitiço da verdade sobre ela. Mais tarde, é descoberto que o feitiço não foi removido, fazendo a garota falar a verdade sobre todos durante seu discurso, e em seguida, fazendo todos os estudantes odiarem ela.
Quando Alex deixa o portal para o Mundo do Feitiço aberto, um inseto mágico voa e pica Jerry, ele tem uma má reação à picada e é transformado em uma barata gigante. Enquanto isso, Justin se prepara para seu Banquete da Língua Alienígena na Estação Waverly.
Alex e Harper descobrem que Max tem uma namorada chamada Nancy, e que ele está mentindo para ela sobre quem ele realmente é, assim sua família não pode constrangê-lo. Quando sua mãe o incentiva a ser verdadeiro com sua nova namorada, Max revela para ela que ele é um feiticeiro
